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代谢通路图生成 (Pathway Diagram)
以神经酰胺合成和代谢通路为例，展示如何生成BioRender风格的代谢路径图
1 神经酰胺合成和代谢通路图提示词
Prompt: 你是一个专业的生物医学插图设计师，擅长使用bioRender风格创建机制图。 根据提供的背景知识，帮我生成神经酰胺合成和代谢通路图的提示词。 要求： 1. 基于背景知识，识别关键代谢物和酶 2. 展示神经酰胺的合成路径（从头合成途径和鞘磷脂水解途径） 3. 展示神经酰胺的代谢路径（转化为鞘氨醇、鞘磷脂、葡萄糖神经酰胺等） 4. 使用bioRender风格：简洁、专业、矢量图形 5. 使用箭头表示反应方向，标注关键酶 6. 最终输出仅为生成的图像描述 背景知识： [粘贴神经酰胺代谢的背景知识]
💡 提示：这个提示词可以适配到其他代谢通路，只需替换"神经酰胺"和对应的背景知识
2 通用代谢通路图提示词模板
Prompt: 你是一个专业的生物医学插图设计师，擅长使用bioRender风格创建代谢通路图。 根据提供的背景知识，帮我生成 [代谢物名称] 合成和代谢通路图的提示词。 要求： 1. 识别关键代谢物、酶和转运体 2. 展示主要的合成路径 3. 展示主要的代谢/降解路径 4. 标注关键调节位点（如激活、抑制） 5. 使用bioRender风格：简洁、专业、矢量图形 6. 使用箭头表示反应方向，不同颜色表示不同路径分支 7. 最终输出仅为生成的图像描述 背景知识： [粘贴代谢通路背景知识]
3 神经酰胺代谢通路关键节点示例
从头合成途径 (De Novo Synthesis)
棕榈酰辅酶A
↓
3-酮鞘氨醇
↓
鞘氨醇
↓
神经酰胺
鞘磷脂水解途径 (Sphingomyelinase Pathway)
鞘磷脂
↓ 鞘磷脂酶
神经酰胺
代谢路径 (Metabolism)
神经酰胺
↓
鞘氨醇
↓
鞘氨醇-1-磷酸 (S1P)
神经酰胺
↓
葡萄糖神经酰胺
神经酰胺
↓
鞘磷脂
4 BioRender通路图设计原则
1. 层次清晰
- • 从上到下或从左到右展示代谢流向
- • 主要路径使用粗箭头，次要路径使用细箭头
- • 关键代谢物使用大号字体突出显示
2. 颜色编码
- • 合成路径：蓝色/绿色
- • 代谢路径：橙色/红色
- • 调节分子：紫色
- • 酶：灰色/黑色小字标注
3. 简洁专业
- • 只保留核心通路，避免信息过载
- • 使用标准分子图标（圆形、六边形等）
- • 箭头样式统一（实线=主反应，虚线=调节）
4. 可读性
- • 字体大小适合论文发表
- • 分子名称使用中文+英文对照
- • 避免箭头交叉，保持路径清晰
5 常见代谢通路类型
糖代谢
- • 糖酵解 (Glycolysis)
- • 糖异生 (Gluconeogenesis)
- • 磷酸戊糖途径 (PPP)
脂质代谢
- • 脂肪酸合成
- • β-氧化
- • 胆固醇代谢
- • 神经酰胺代谢
氨基酸代谢
- • 支链氨基酸代谢
- • 谷氨酰胺代谢
- • 色氨酸代谢
信号通路
- • PI3K-AKT通路
- • MAPK通路
- • NF-κB通路
- • Wnt/β-catenin通路
💡 使用建议
- • 提供完整背景知识：包含关键酶、中间产物、调节因子
- • 明确展示重点：告诉AI哪个路径需要突出显示
- • 分步生成：复杂通路可以先生成主路径，再添加分支
- • 后期调整：AI生成的描述用于绘图工具，生成后可手动调整布局
- • 矢量化处理：使用AI工具生成后，导入Illustrator进行矢量化