富集分析的分类方法: 1. 按照方法学分类: - ORA(超几何分布)(Over-Repressentation Analysis) - GSEA(如gseGO):考虑到分组信息的 2. 按照数据库来分析:GO,KEGG,cibsort分析,代谢数据库等等
GO只是个数据库,你用什么算法取决于你自己,enrichGO() , gseaGO() 都可以
GO:告诉你功能,富集到哪些通路 GSEA告诉你富集到的这个通路是上调还是下调
先 GO 分析,然后再 GSEA,GO定性,GSEA定量 相关主题:聊天记录