主讲老师第六十五课：ceRNA 的桑基图绘制
桑基图（Sankey diagram），当然，也有人根据其形状称为“决策树”， 或者因其流向称为“流程图”。桑基图由于其独特的特征，能够很好的反映组间变量的相互作用关系：1). 起始流量和结束流量相同，也就是我们常说的能量守恒；2).在图形内部，不同的线条代表了不同的分流情况，线条的粗细与其占比成正比例。目前，除了相关性分析外，桑基图也常常用于 ceRNA 的可视化方式。下面，我们来看下如何基于 ceRNA 调控网络进行桑基图的绘制（ceRNA_plot.zip）
1.读取数据
首先，分别读取分析得到的 miRNA_mRNA 和 lncRNA_miRNA 之间的交互关系
2.整合数据
通过 miRNA，使用 merge() 函数将两个交互网络进行合并。
随后，将宽数据转化为长数据。
3.桑基图的绘制
3.1 指定颜色
首先，我们需要对每个基因内容分配颜色，这里使用 rainbow() 彩虹颜色函数。
3.2 绘制桑基图
首先，加载绘图使用的 R 包，在此，我们使用 ggalluvial 包来绘制桑基图。
基于 ggplot()函数，使用 geom_stratum()来指定桑基图中的堆叠柱形图在文章里面，习惯了 Cytoscape 的结果后，偶尔用用这样的结果图也是不错的