首页 / R语言实战教程 / 单细胞分析 R 路线图

单细胞分析 R 路线图

把你本地训练营笔记和站内单细胞模块串成一条实战路径：先补R基础，再做降维聚类、注释、轨迹和空间组学。

① 先修：R基础与数据处理

R包安装与环境准备 dplyr 数据清洗主线 ggplot2 绘图系统 PCA 降维预检（训练营笔记）

② 主线：单细胞分析模块

Seurat 基础流程 Seurat 函数手册细胞注释方法学拟时序分析空间转录组进入单细胞模块总导航

③ 配套：训练营生信笔记

GO 分析 KEGG 分析 GSVA 分析 SNP 数据展示

推荐起步脚本

library(Seurat)
library(dplyr)
library(ggplot2) sce <- Read10X("data/filtered_feature_bc_matrix/")
obj <- CreateSeuratObject(counts = sce, min.cells = 3, min.features = 200)
obj <- NormalizeData(obj) |> FindVariableFeatures |> ScaleData
obj <- RunPCA(obj) |> FindNeighbors(dims = 1:20) |> FindClusters |> RunUMAP(dims = 1:20)
DimPlot(obj, reduction = "umap", group.by = "seurat_clusters")