答疑补充 016

第 16 课 · 答疑与补充

Count、TPM、FPKM数据转换|聚焦本课答疑、作业提醒、报错排查与方法补充

说明:本页汇总与本课相关的答疑、作业提醒、报错排查与方法补充,便于集中查阅。

度,最终得到 FPKM 值。这里需要注意一点,严格来讲,这里的基因长度是指基因外显子的总长度

TPM 值的,因此在后续的分析过程中我们一般是推荐使用 TPM 值的

注意不同的物种之间是不一样的, getBM 函数是检索数据用到的主要函数。

完成了,此时,得到了两份不同思路计算得到的基因长度文件。在此,推荐大家在后续 的分析过程中,

这样,count 值,FPKM 值和 TPM 值之间的转换就完成了。在单基因分析模式中,一般还是推荐使用

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