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R 医学统计实战路线图

这一页把 R 医学统计学习路径拆成可直接执行的模块:先搭环境,再完成描述统计、组间比较、回归、生存分析和竞争风险, 最终能够把示例脚本迁移到自己的医学课题数据上。

21 个 R 脚本 26 组 CSV 数据 8 份 PDF / 讲义 含森林图预览
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模块切换与学习路径

总览页

这里先看全局结构;点击任一模块即可进入对应详情子页,查看“学什么 / 用什么数据 / 适合什么课题”。

这份资料包已经能覆盖什么

从文件结构看,这不是零散脚本,而是一套相对完整的医学统计练习资源: 包含 R 与 RStudio 安装指引、数据读取示例、描述性统计、t 检验与秩和检验、卡方检验、单/双因素方差分析、 相关性分析,以及线性回归、Logistic 回归、泊松回归、Cox 回归、竞争风险、列线图和森林图。

页面重点展示方法结构、代表性脚本名与图形预览,方便先判断这套资料是否适合你的课题方向。

建议使用方式

  1. 1. 先把环境安装、R Project 和相对路径读懂。
  2. 2. 用描述统计、t 检验、卡方和方差分析完成基础练习。
  3. 3. 进入线性 / Logistic / 泊松回归,理解变量类型和模型解释。
  4. 4. 最后接入生存、竞争风险和图形输出,做自己的课题复现。
模块 A

安装与工程组织

R / RStudio 安装、R Project 使用、相对路径读数和环境自检。

PDF 3 视频 2
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模块 B

R 基础与数据读取

CSV / XLSX / SAV 读取、基础对象操作、数据框观察和编码习惯。

脚本 2 示例数据 2
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模块 C

描述统计与组间比较

描述性统计、t 检验、秩和检验、卡方检验、单/双因素方差分析。

脚本 5 CSV 13+
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模块 D

相关与线性建模

相关性检验、简单线性回归、多元线性回归和回归诊断。

脚本 4 临床表型数据
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模块 E

回归、预测与图形表达

Logistic、泊松回归、列线图、森林图和课题汇报图形输出。

脚本 5+ 森林图示例
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模块 F

生存分析与竞争风险

Kaplan-Meier、Log-rank、Cox 比例风险和竞争风险模型。

脚本 4 SAV / CSV 实例
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推荐学习路径: 先完成白话统计学中关于数据类型、假设检验和回归思维的章节,再按照本页的六个模块做一轮代码复现; 真正进入课题数据时,优先把变量字典、结局定义和缺失值处理补齐,再迁移对应脚本。
模块 A

安装与工程组织

资料包里同时放了安装 PDF、视频和系统安装包,说明这套材料不是默认你已经会用 R,而是从环境搭建开始带你走。 真正值得迁移到课题流程的是:先建立 R Project,再用相对路径组织数据和脚本。

  • • 覆盖内容:R 与 RStudio 安装、版本切换、环境测试、R Project 使用。
  • • 代表材料:R语言安装教程及注意事项12.18.pdf
  • • 迁移建议:把原始数据、清洗脚本、分析脚本都放进同一个项目目录,避免绝对路径失效。

可下载资源

安装模块提供环境说明与相对路径示例,适合先搭好项目结构,再把自己的数据接入分析流程。

下载模块包
模块 B

R 基础与数据读取

基础部分的重点是“怎么把医学数据正确读进来”。脚本里涉及 CSV、Excel、SPSS 等不同格式, 这非常贴合临床课题常见的数据来源。

  • • 代表脚本:R基础/1.RR基础/数据读取.R
  • • 典型数据:1.csv1.xlsx、临床预测模型中的 lowweight.sav
  • • 适合练习:变量类型识别、因子转换、表头规范化、相对路径读数。
模块 C

描述统计与组间比较

这部分最适合作为“从论文表 1 到方法部分”的训练材料。描述统计、t 检验、秩和检验、卡方检验和方差分析都在, 还包含单向有序、双向无序、分层列联表和重复测量等细分场景。

  • • 代表脚本:描述性统计分析.Rt检验.R卡方检验.R单因素方差分析.R
  • • 代表数据:普通四格表卡方检验.csv重复测量设计.csvFriedman.csv
  • • 适合练习:先判断变量类型和分布,再决定参数 / 非参数方法与多重比较策略。
模块 D

相关分析与线性建模

如果你的课题结局是连续型指标,这一组材料最值得优先复现。 从相关性检验到简单 / 多元线性回归,再到回归诊断,形成了一条比较完整的线性建模主线。

  • • 代表脚本:相关性检验.R简单线性回归.R多元线性回归.R回归诊断.R
  • • 代表数据:insurance.csv简单线性回归.csv
  • • 适合练习:残差诊断、共线性判断、连续自变量解释和模型报告书写。
模块 E

回归、预测与图形表达

这一块把临床研究里最常见的二分类结局、计数结局和可视化汇报串到了一起。 除了 Logistic 与泊松回归,资料里还放了列线图、森林图和独立绘图脚本,适合直接服务论文结果展示。

  • • 代表脚本:逻辑回归.R泊松回归.R(基于Logistic回归)临床预测模型.R森林图绘制.R
  • • 代表输出:森林图、列线图、回归系数表和课题图形汇报素材。
  • • 适合练习:OR / RR / HR 的差异、分类自变量编码、预测模型可视化。
模块 F

生存分析与竞争风险

对于临床结局带时间维度的课题,这部分已经进入实战层级:不仅有 Kaplan-Meier 与 Cox, 还有竞争风险模型和基于 Cox 的森林图 / 列线图绘制脚本。

  • • 代表脚本:生存分析.Rcox比例风险模型.R竞争风险模型.R
  • • 代表数据:logrank.csvoutput.csvcox单因素多因素分析.sav
  • • 适合练习:时间到事件定义、删失处理、风险比解释和生存曲线汇报。

图形产出预览

资料包中包含一张森林图案例示意,适合用来理解回归结果在论文中的图形呈现方式。

  • • 图中能直接看到的核心字段包括 SubgroupHR(95%CI)p value 等统计图要素。
  • • 预览重点放在分层、效应量与显著性信息,适合对照自己的回归输出检查图形结构。
  • • 网页展示的是压缩后的预览版本,仅用于说明“回归结果如何转成论文图形”。
森林图案例预览
森林图示例预览:适合配合 Logistic / Cox 回归结果做亚组展示与论文图形整理。

把资料包迁移到自己课题的最短路径

第一步:整理变量字典

先明确结局变量、暴露变量、协变量和时间变量分别是什么,再决定进入哪条脚本主线。

第二步:用示例脚本替换输入

优先替换数据读入、变量重编码和模型公式部分,不要一开始就改动全部绘图参数。

第三步:同步输出表格和图形

每跑通一个模型,就同时保存结果表与图,避免后期只能回忆分析步骤却复现不出图。

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